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Zuker-Algorithmus

Index Zuker-Algorithmus

Der Zuker-Algorithmus berechnet die optimale Sekundärstruktur einer RNA-Sequenz mit der minimalen freien Energie unter einem gegebenen thermodynamischen Modell.

Inhaltsverzeichnis

  1. 10 Beziehungen: Algorithmus, Backtracking, Dynamische Programmierung, Gotoh-Algorithmus, Nucleic Acids Research, Nussinov-Algorithmus, Ribonukleinsäure, Sekundärstruktur, Sequenzalignment, 1981.

Algorithmus

sowjetischen Briefmarke anlässlich seines 1200-jährigen Geburtsjubiläums Ein Algorithmus (benannt nach al-Chwarizmi, von arabisch: Choresmier) ist eine eindeutige Handlungsvorschrift zur Lösung eines Problems oder einer Klasse von Problemen.

Sehen Zuker-Algorithmus und Algorithmus

Backtracking

Backtracking arbeitet nach dem Prinzip der Tiefensuche Der Begriff Rücksetzverfahren oder englisch Backtracking (Rückverfolgung) bezeichnet eine Problemlösungsmethode innerhalb der Algorithmik.

Sehen Zuker-Algorithmus und Backtracking

Dynamische Programmierung

Dynamische Programmierung ist eine Methode zum algorithmischen Lösen eines Optimierungsproblems durch Aufteilung in Teilprobleme und systematische Speicherung von Zwischenresultaten.

Sehen Zuker-Algorithmus und Dynamische Programmierung

Gotoh-Algorithmus

Der Gotoh-Algorithmus berechnet das Alignment von zwei Sequenzen bei affinen Gapkosten.

Sehen Zuker-Algorithmus und Gotoh-Algorithmus

Nucleic Acids Research

Nucleic Acids Research, abgekürzt Nucleic Acids Res. ist eine wissenschaftliche Zeitschrift, die vom Oxford-University-Press-Verlag veröffentlicht wird.

Sehen Zuker-Algorithmus und Nucleic Acids Research

Nussinov-Algorithmus

Eine von dem Nussinov-Algorithmus berechnete optimale Sekundärstruktur einer RNA-Sequenz aus einem Viren-Genom. Sie hat 18 Basenpaare und es existieren 41 weitere co-optimale Sekundärstrukturen dieser Eingabesequenz mit 18 Basenpaaren. Der Nussinov-Algorithmus ist ein einfacher Algorithmus zur Berechnung der maximal möglichen Anzahl von Basenpaaren in einer RNA-Sequenz und einer oder mehrerer möglicher Sekundärstrukturen dieser RNA-Sequenz.

Sehen Zuker-Algorithmus und Nussinov-Algorithmus

Ribonukleinsäure

Verknüpfung der Nukleinbasen (C, G, A und U) über ein Zucker- (grau) und Phosphatrückgrat (türkis) zur RNA Ribonukleinsäure (Ribo|nukle-in|säure, kurz RNS; englisch RNA für ribonucleic acid; lateinisch-französisch-griechisches Kunstwort) ist eine Nukleinsäure, die sich als Polynukleotid aus einer Kette von vielen Nukleotiden zusammensetzt.

Sehen Zuker-Algorithmus und Ribonukleinsäure

Sekundärstruktur

upright.

Sehen Zuker-Algorithmus und Sekundärstruktur

Sequenzalignment

Sequenzalignment (von lateinisch sequentia, „Aufeinanderfolge“ und englisch alignment, „Abgleich, Anordnung, Ausrichtung“) bezeichnet den methodischen Vergleich zweier oder mehrerer Nukleotid- oder Aminosäuresequenzen in linearer Abfolge.

Sehen Zuker-Algorithmus und Sequenzalignment

1981

Das Jahr 1981 stand teilweise im Zeichen der Friedensbewegung.

Sehen Zuker-Algorithmus und 1981