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Gotoh-Algorithmus

Index Gotoh-Algorithmus

Der Gotoh-Algorithmus berechnet das Alignment von zwei Sequenzen bei affinen Gapkosten.

Inhaltsverzeichnis

  1. 14 Beziehungen: CDNA, Common Gateway Interface, Desoxyribonukleinsäure, Dynamische Programmierung, Gap (Bioinformatik), Hirschberg-Algorithmus, Journal of Molecular Biology, Landau-Symbole, Lineare Funktion, Matrix (Mathematik), Needleman-Wunsch-Algorithmus, Sequenzalignment, Skriptsprache, Teile-und-herrsche-Verfahren.

CDNA

Die cDNA ist eine DNA, die mittels des Enzyms Reverse Transkriptase als Abschrift einer RNA (beispielsweise mRNA oder ncRNA) synthetisiert wird.

Sehen Gotoh-Algorithmus und CDNA

Common Gateway Interface

Das Common Gateway Interface (CGI) ist eine Schnittstelle für den Datenaustausch zwischen einem Webserver (Anwendungsprogramm) und dritter Software, die Anfragen bearbeitet.

Sehen Gotoh-Algorithmus und Common Gateway Interface

Desoxyribonukleinsäure

DNA-Helix in B-Konformation (Struktur­modell): Die Stickstoff (blau) enthaltenden Nukleinbasen liegen waagrecht zwischen zwei Rückgratsträngen, welche sehr reich an Sauerstoff (rot) sind. Kohlenstoff ist grün dargestellt. Desoxyribonukleinsäure (abgekürzt DNS), meist kurz als DNA (Abkürzung für) bezeichnet, ist eine aus unterschiedlichen Desoxyribonukleotiden aufgebaute Nukleinsäure.

Sehen Gotoh-Algorithmus und Desoxyribonukleinsäure

Dynamische Programmierung

Dynamische Programmierung ist eine Methode zum algorithmischen Lösen eines Optimierungsproblems durch Aufteilung in Teilprobleme und systematische Speicherung von Zwischenresultaten.

Sehen Gotoh-Algorithmus und Dynamische Programmierung

Gap (Bioinformatik)

Ein Gap (engl., zu deutsch: Lücke) bezeichnet in der Bioinformatik eine Lücke oder Leerstelle in einer Sequenz, insbesondere beim Sequenzalignment.

Sehen Gotoh-Algorithmus und Gap (Bioinformatik)

Hirschberg-Algorithmus

Der Hirschberg-Algorithmus berechnet das paarweise Sequenzalignment und hat einen zur Eingabe linearen Speicherbedarf.

Sehen Gotoh-Algorithmus und Hirschberg-Algorithmus

Journal of Molecular Biology

Das Journal of Molecular Biology, abgekürzt J. Mol.

Sehen Gotoh-Algorithmus und Journal of Molecular Biology

Landau-Symbole

Landau-Symbole (auch O-Notation) werden in der Mathematik und in der Informatik verwendet, um das asymptotische Verhalten von Funktionen und Folgen zu beschreiben.

Sehen Gotoh-Algorithmus und Landau-Symbole

Lineare Funktion

Als lineare Funktion wird oft (insbesondere in der Schulmathematik) eine Funktion f\colon\R\to\R der Form also eine Polynomfunktion höchstens ersten Grades bezeichnet.

Sehen Gotoh-Algorithmus und Lineare Funktion

Matrix (Mathematik)

Schema für eine allgemeine m\times n-Matrix Bezeichnungen In der Mathematik versteht man unter einer Matrix (Plural Matrizen) eine rechteckige Anordnung (Tabelle) von Elementen (meist mathematischer Objekte, etwa Zahlen).

Sehen Gotoh-Algorithmus und Matrix (Mathematik)

Needleman-Wunsch-Algorithmus

Der Needleman-Wunsch-Algorithmus ist ein Optimierungsalgorithmus aus der Bioinformatik.

Sehen Gotoh-Algorithmus und Needleman-Wunsch-Algorithmus

Sequenzalignment

Sequenzalignment (von lateinisch sequentia, „Aufeinanderfolge“ und englisch alignment, „Abgleich, Anordnung, Ausrichtung“) bezeichnet den methodischen Vergleich zweier oder mehrerer Nukleotid- oder Aminosäuresequenzen in linearer Abfolge.

Sehen Gotoh-Algorithmus und Sequenzalignment

Skriptsprache

Skriptsprachen (auch Scriptsprachen) sind Programmiersprachen, die über einen Interpreter ausgeführt werden.

Sehen Gotoh-Algorithmus und Skriptsprache

Teile-und-herrsche-Verfahren

Das Teile-und-herrsche-Verfahren (bzw.) bezeichnet in der Informatik ein Paradigma für den Entwurf von effizienten Algorithmen.

Sehen Gotoh-Algorithmus und Teile-und-herrsche-Verfahren

Auch bekannt als Gotoh.