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CHARMM

Index CHARMM

CHARMM (Chemistry at Harvard Macromolecular Mechanics) ist ein Programm für molekulardynamische Berechnungen von (biologischen) Makromolekülen wie Proteinen und DNA.

Inhaltsverzeichnis

  1. 8 Beziehungen: AMBER, BALL, GROMACS, Kraftfeld (Computerphysik), Martin Karplus, Molekulare Mechanik, NAMD, ReaxFF.

AMBER

Assisted Model Building with Energy Refinement (AMBER) ist ein Programm für molekulardynamische Berechnungen (MD) von (biologischen) Makromolekülen wie Proteinen und DNA.

Sehen CHARMM und AMBER

BALL

Die (Biochemical Algorithms Library) BALL ist ein umfassendes Open-Source-Framework zur schnellen Anwendungsentwicklung für die strukturelle Bioinformatik.

Sehen CHARMM und BALL

GROMACS

GROMACS (Groningen Machine for Chemical Simulations) ist ein Softwarepaket für Simulationen und Auswertungen molekulardynamischer Prozesse (MD), das ursprünglich an der Universität Groningen entwickelt wurde.

Sehen CHARMM und GROMACS

Kraftfeld (Computerphysik)

Ein Kraftfeld (englisch: force field) ist in der Computerphysik und verwandten Disziplinen, wie der Theoretischen Chemie, eine Parametrisierung der potentiellen Energie und kommt insbesondere bei der Beschreibung von Molekülen zum Einsatz.

Sehen CHARMM und Kraftfeld (Computerphysik)

Martin Karplus

Martin Karplus 2013 Martin Karplus (* 15. März 1930 in Wien) ist ein US-amerikanischer theoretischer Chemiker österreichischer Herkunft.

Sehen CHARMM und Martin Karplus

Molekulare Mechanik

Kraftfeld wird verwendet um die Bindungsenergie dieses Ethanmoleküls zu minimieren. Die Molekulare Mechanik bedient sich der klassischen Mechanik, um molekulare Systeme zu modellieren.

Sehen CHARMM und Molekulare Mechanik

NAMD

NAMD (Nanoscale Molecular Dynamics program) ist ein Programm zur Simulation molekulardynamischer Prozesse, das an der University of Illinois at Urbana-Champaign als Kooperationsprojekt zwischen der Theoretical and Computational Biophysics Group (TCB) und dem Parallel Programming Laboratory (PPL) entwickelt wird.

Sehen CHARMM und NAMD

ReaxFF

ReaxFF (für, Reaktions-Kraftfeld) ist ein Kraftfeld zur Simulation chemischer Reaktionen, welches auf der Bindungsordnung basiert.

Sehen CHARMM und ReaxFF