Schneller Zugriff als Browser!
37 Beziehungen: AMBER, Aminosäuren, Benzol, CHARMM, Coulombsches Gesetz, Diederwinkel, Docking (Chemie), Enthalpie, Entropie, Ergodenhypothese, Ghemical, Gibbs-Energie, Gradientenverfahren, GROMACS, GROMOS, Harmonischer Oszillator, Kinetik (Chemie), Klassische Mechanik, Konformation, Kraftfeld (Computerphysik), LAMMPS, Lennard-Jones-Potential, Mathematische Optimierung, Methylgruppe, Metropolis-Algorithmus, Mode (Physik), Molekular, Molekulardynamik-Simulation, Monte-Carlo-Simulation, Morse-Potential, NAMD, Protein, Proteindesign, Simulated Annealing, Thermodynamik, Van-der-Waals-Kräfte, Van-der-Waals-Radius.
AMBER
Assisted Model Building with Energy Refinement (AMBER) ist ein Programm für molekulardynamische Berechnungen (MD) von (biologischen) Makromolekülen wie Proteinen und DNA.
Neu!!: Molekulare Mechanik und AMBER · Mehr sehen »
Aminosäuren
H-Atom) Aminosäuren (AS), unüblich aber genauer auch Aminocarbonsäuren, veraltet Amidosäuren genannt, sind chemische Verbindungen mit einer Stickstoff (N) enthaltenden Aminogruppe und einer Kohlenstoff (C) und Sauerstoff (O) enthaltenden Carbonsäuregruppe.
Neu!!: Molekulare Mechanik und Aminosäuren · Mehr sehen »
Benzol
Benzol (nach IUPAC Benzen) ist eine chemische Verbindung aus der Stoffgruppe der Kohlenwasserstoffe.
Neu!!: Molekulare Mechanik und Benzol · Mehr sehen »
CHARMM
CHARMM (Chemistry at Harvard Macromolecular Mechanics) ist ein Programm für molekulardynamische Berechnungen von (biologischen) Makromolekülen wie Proteinen und DNA.
Neu!!: Molekulare Mechanik und CHARMM · Mehr sehen »
Coulombsches Gesetz
Das coulombsche Gesetz oder Coulomb-Gesetz ist die Basis der Elektrostatik.
Neu!!: Molekulare Mechanik und Coulombsches Gesetz · Mehr sehen »
Diederwinkel
Der Dieder- oder Torsionswinkel beschreibt in der Geometrie den Winkel zwischen zwei durch jeweils drei ebene Punkte aufgespannten Flächen.
Neu!!: Molekulare Mechanik und Diederwinkel · Mehr sehen »
Docking (Chemie)
Molekulares Docking (kurz Docking, dt.: Ankuppeln, Einpassen) ist ein bioinformatisches/chemoinformatisches Verfahren, mit dem der Bindungsmodus und idealerweise auch die Bindungsenergie zweier aneinanderbindender Biomoleküle vorhergesagt wird.
Neu!!: Molekulare Mechanik und Docking (Chemie) · Mehr sehen »
Enthalpie
Die Reaktionsenthalpie der Verbrennung von Alkohol an der Luft ist negativ. Es handelt sich also um eine exotherme Reaktion, bei der Wärme an die Umgebung abgegeben wird. Die Schmelzenthalpie ist die notwendige Energiemenge, die zum Schmelzen des Eises bei konstantem Druck aufgebracht werden muss. Sie wird der Umgebung entzogen und kühlt dabei das Getränk. Die Enthalpie H (von), früher auch Wärmeinhalt, eines thermodynamischen Systems ist die Summe aus der inneren Energie U des Systems und der Volumenarbeit, also dem Produkt aus Druck p und Volumen V des Systems.
Neu!!: Molekulare Mechanik und Enthalpie · Mehr sehen »
Entropie
Beim Schmelzen von Eis wird die geordnete Eiskristallstruktur in eine ungeordnete Bewegung einzelner Wassermoleküle überführt: ''Die Entropie des Wassers im Eiswürfel nimmt dabei zu'' (Rudolf Clausius 1862) Die Entropie ist eine in der Thermodynamik definierte physikalische Größe von fundamentaler Bedeutung.
Neu!!: Molekulare Mechanik und Entropie · Mehr sehen »
Ergodenhypothese
Die Ergodenhypothese (oft auch als Ergodentheorem bezeichnet) besagt, dass sich thermodynamische Systeme in der Regel zufällig verhalten („molekulares Chaos“), sodass alle energetisch möglichen Phasenraum-Regionen auch erreicht werden.
Neu!!: Molekulare Mechanik und Ergodenhypothese · Mehr sehen »
Ghemical
Ghemical ist eine Computerchemie-Software, die unter der GPL steht.
Neu!!: Molekulare Mechanik und Ghemical · Mehr sehen »
Gibbs-Energie
Die Gibbs-Energie (auch freie Enthalpie), benannt nach Josiah Willard Gibbs, ist ein thermodynamisches Potential, also eine Zustandsgröße in der Thermodynamik.
Neu!!: Molekulare Mechanik und Gibbs-Energie · Mehr sehen »
Gradientenverfahren
Das Gradientenverfahren wird in der Numerik eingesetzt, um allgemeine Optimierungsprobleme zu lösen.
Neu!!: Molekulare Mechanik und Gradientenverfahren · Mehr sehen »
GROMACS
GROMACS (Groningen Machine for Chemical Simulations) ist ein Softwarepaket für Simulationen und Auswertungen molekulardynamischer Prozesse (MD), das ursprünglich an der Universität Groningen entwickelt wurde.
Neu!!: Molekulare Mechanik und GROMACS · Mehr sehen »
GROMOS
GROMOS bezeichnet zum einen ein Kraftfeld, wie es zur Berechnung molekulardynamischer Simulationen benötigt wird.
Neu!!: Molekulare Mechanik und GROMOS · Mehr sehen »
Harmonischer Oszillator
Ein harmonischer Oszillator ist ein schwingungsfähiges System, das sich durch eine lineare Rückstellgröße auszeichnet.
Neu!!: Molekulare Mechanik und Harmonischer Oszillator · Mehr sehen »
Kinetik (Chemie)
Ludwig Ferdinand Wilhelmy; er veröffentlichte 1850 die erste quantitative Untersuchung der chemischen Kinetik (Zerfall von Rohrzucker). Die Kinetik ist ein Teilbereich der physikalischen Chemie, der in Makrokinetik und molekulare Kinetik unterteilt wird.
Neu!!: Molekulare Mechanik und Kinetik (Chemie) · Mehr sehen »
Klassische Mechanik
mathematische Pendel – ein typischer Anwendungsfall der klassischen Mechanik Die klassische Mechanik oder Newtonsche Mechanik ist das Teilgebiet der Physik, das die Bewegung von festen, flüssigen oder gasförmigen Körpern unter dem Einfluss von Kräften beschreibt.
Neu!!: Molekulare Mechanik und Klassische Mechanik · Mehr sehen »
Konformation
Sägebock- und Newman-Projektion gestaffelte Konformation in Sägebock- und Newman-Projektion Die Konformation beschreibt in der Chemie die räumliche Anordnung der Atome eines Moleküls bei gegebener Konstitution und Konfiguration.
Neu!!: Molekulare Mechanik und Konformation · Mehr sehen »
Kraftfeld (Computerphysik)
Ein Kraftfeld (englisch: force field) ist in der Computerphysik und verwandten Disziplinen, wie der Theoretischen Chemie, eine Parametrisierung der potentiellen Energie und kommt insbesondere bei der Beschreibung von Molekülen zum Einsatz.
Neu!!: Molekulare Mechanik und Kraftfeld (Computerphysik) · Mehr sehen »
LAMMPS
Large-scale Atomic/Molecular Massively Parallel Simulator (LAMMPS) ist eine Software für Molekulardynamik-Simulation von Sandia National Laboratories.
Neu!!: Molekulare Mechanik und LAMMPS · Mehr sehen »
Lennard-Jones-Potential
Das Lennard-Jones-Potential V (nach John Lennard-Jones) beschreibt in der physikalischen Chemie und in der Atom- und Molekülphysik die Bindungsenergie.
Neu!!: Molekulare Mechanik und Lennard-Jones-Potential · Mehr sehen »
Mathematische Optimierung
Die mathematische Optimierung ist ein Teilgebiet der angewandten Mathematik, welches sich mit dem Lösen von Optimierungsproblemen beschäftigt.
Neu!!: Molekulare Mechanik und Mathematische Optimierung · Mehr sehen »
Methylgruppe
Alkenyl, Aryl etc. oder andere Reste mit einer freien Valenz. Die Methylgruppe (auch als Methyl-Rest bezeichnet) ist eine der einfachsten Atomanordnungen in der organischen Chemie.
Neu!!: Molekulare Mechanik und Methylgruppe · Mehr sehen »
Metropolis-Algorithmus
Der Metropolis-Algorithmus ist ein Markov-Chain-Monte-Carlo-Verfahren (MCMC) zur Erzeugung von Zuständen eines Systems entsprechend der Boltzmann-Verteilung.
Neu!!: Molekulare Mechanik und Metropolis-Algorithmus · Mehr sehen »
Mode (Physik)
Die ersten sechs Moden eines Resonators Eine Mode (von engl. mode), auch Schwingungsmode, in der Akustik auch Raummode, in der Mechanik auch Eigenform, Eigenschwingungsform oder Partialschwingung, ist in der Physik die Beschreibung bestimmter zeitlich stationärer Eigenschaften einer Welle.
Neu!!: Molekulare Mechanik und Mode (Physik) · Mehr sehen »
Molekular
Ein Vorgang in den Naturwissenschaften ist molekular (lat. molecula, Diminutiv von moles ‚Masse‘), wenn er die Ebene der Moleküle oder die Moleküle selbst betrifft.
Neu!!: Molekulare Mechanik und Molekular · Mehr sehen »
Molekulardynamik-Simulation
Moleküldynamik oder Molekulardynamik (MD) bezeichnet Computersimulationen in der molekularen Modellierung, bei denen Wechselwirkungen zwischen Atomen und Molekülen und deren sich daraus ergebende räumliche Bewegungen iterativ berechnet und dargestellt werden.
Neu!!: Molekulare Mechanik und Molekulardynamik-Simulation · Mehr sehen »
Monte-Carlo-Simulation
Gesetzes der großen Zahlen sinkt mit steigender Anzahl von Experimenten die Varianz des Ergebnisses. Für mehr Details siehe unten. Monte-Carlo-Simulation (auch MC-Simulation oder Monte-Carlo-Studie) ist ein Verfahren aus der Stochastik bzw.
Neu!!: Molekulare Mechanik und Monte-Carlo-Simulation · Mehr sehen »
Morse-Potential
harmonischen Oszillators (grün).Eingezeichnet sind auch die Energiestufen, die beim Harmonischen Oszillator äquidistant sind (\hbar \omega), beim Morsepotential hingegen mit zunehmender Energie immer weniger Abstand haben, bis zur Bindungsenergie D_e, die größer als die tatsächlich benötigte Energie D_0 zur Flucht aus der Potentialmulde ist, da die Nullpunktenergie \left(\nu.
Neu!!: Molekulare Mechanik und Morse-Potential · Mehr sehen »
NAMD
NAMD (Nanoscale Molecular Dynamics program) ist ein Programm zur Simulation molekulardynamischer Prozesse, das an der University of Illinois at Urbana-Champaign als Kooperationsprojekt zwischen der Theoretical and Computational Biophysics Group (TCB) und dem Parallel Programming Laboratory (PPL) entwickelt wird.
Neu!!: Molekulare Mechanik und NAMD · Mehr sehen »
Protein
O2 anlagern kann. Ein Protein, umgangssprachlich Eiweiß (veraltet Eiweißstoff) genannt, ist ein biologisches Makromolekül, das aus Aminosäuren aufgebaut wird, die durch Peptidbindungen verknüpft sind.
Neu!!: Molekulare Mechanik und Protein · Mehr sehen »
Proteindesign
Energiepotentiale verschiedener Konfigurationen Energiepotentiale verschiedener Stoffgruppen Das Proteindesign, synonym Proteinoptimierung oder rationales Proteindesign, bezeichnet die gezielte Anpassung der Eigenschaften von Proteinen durch ortsspezifische Mutagenese der DNA.
Neu!!: Molekulare Mechanik und Proteindesign · Mehr sehen »
Simulated Annealing
Simulated Annealing (engl. für simuliertes Tempern/ spannungsfrei Machen/ Vergüten) ist ein heuristisches Approximationsverfahren.
Neu!!: Molekulare Mechanik und Simulated Annealing · Mehr sehen »
Thermodynamik
Typischer thermodynamischer Vorgang am Beispiel der prinzipiellen Wirkungsweise eines durch Dampf betriebenen Motors (rot.
Neu!!: Molekulare Mechanik und Thermodynamik · Mehr sehen »
Van-der-Waals-Kräfte
Van-der-Waals-Kräfte (Van-der-Waals-Wechselwirkungen), benannt nach dem niederländischen Physiker Johannes Diderik van der Waals, sind die relativ schwachen nicht-kovalenten Wechselwirkungen zwischen Atomen oder Molekülen, deren Wechselwirkungsenergie für kugelförmige Teilchen mit etwa der sechsten Potenz des Abstandes abfällt.
Neu!!: Molekulare Mechanik und Van-der-Waals-Kräfte · Mehr sehen »
Van-der-Waals-Radius
Als Van-der-Waals-Radius r_w (nach Johannes Diderik van der Waals) eines Atoms bezeichnet man den Radius einer gedachten harten Kugel, welche als Modell für das Atomverhalten herangezogen wird.
Neu!!: Molekulare Mechanik und Van-der-Waals-Radius · Mehr sehen »
